慈航法师生前，遗训《十要》勉励僧俗：“一要，亲近明师；二要，依附良伴；三要，精研三藏；四要，严持禁戒；五要，常念圣号；六要，勤行礼拜；七要，念众生苦；八要，发菩提心；九要，济物利生；十要，志愿成佛。”又遗偈曰：“奉劝一切徒众，时时反省为要。每日动念行为，检点功过多少。只要自觉心安，东西南北都好。如果一人未度，切莫自己逃了！法性本来空寂，因果丝毫不少。自作还是自受，谁也替你不了。空花水月道场，处处时时建好。望尔广结善缘，自度度他宜早。偈曰：空手而来，空手而去，来来去去，永无休歇。”来来去去，永无休歇，这就意味着，他回去了，还要乘愿再来，来去没有止息。慈航法师圆寂前数月与道源长老、白圣长老的那次会面中，还有一段对话。听到慈航法师说要“告长假了”，道源长老笑着说：“新年新岁，要说些吉利话才好。”慈航法师笑着回应：“我告诉你们，我是去了又要再来的，所以就叫作请假……”

    慈航法师的去，犹如他的来，来去无碍。他的承担，他的蒙难，他的荣耀，皆因一大事因缘而产生。使命与任务完成了，他就去。需要他的时候，他就来了。1954年，从台湾佛教当时的情况看，危机已经过去。因此，他没有享寿70岁、80岁、90岁，而是60岁。但他说，他还要来的。因为，他还有重要的宏愿没有完成，这个宏愿也是遗愿，就是要落叶归根，就是要回归中国大陆，尤其是福建的剃度出家祖庭弘法度生。慈航法师在《弥勒内院定名的意义》一文中就说：“现在要把弥勒菩萨大慈大悲的精神，乃至无我、无我所的唯识道理，由台湾传布到中国大陆，由大陆传布到全世界，使人人都能够信受奉行。”

    律航法师曾在《我与慈老恩师的关系》一文中说：慈航法师曾表示：“自己只愿世世当法师。”印海法师在《师恩难说尽》一文中说：“慈航法师曾经‘发愿世世生生出家当法师’，不会久住兜率净土的。”

     慈航法师在台6年，时间不算长，但对中国台湾省佛教乃至世界汉传佛教的贡献，可谓巨大。在达心尼师、玄光尼师、妙果长老、道安法师、道源法师、律航法师、圆明法师、默如法师、戒德法师、无上法师等的协助下，困境之中，屡办佛学院，抢救爱护青年僧宝，存续佛教火种。当年追随和亲近他的学僧与法师不下百人，后来多有成就，且不乏现代佛教开拓性之人物，如尚在世的有：台湾的星云大师、净良长老、了中长老、真华长老、宽裕长老、广元长老、晴虚长老；旅菲的自立长老、唯慈长老；旅美的妙峰长老、浩霖长老、印海长老、净海长老。他们住持一方、弘化一方，不仅国内、而且国外，为中国传统佛教走向世界创下了历史性的功绩，而这首功，当推慈航法师。不仅中国汉传佛教因此走向国际化，慈航法师的三大办教理念也走向了国际化，在东南亚、美国等得到卓有成效的实践。慈航法师的三大办教理念，在台湾更是生根发芽开花结果。如星云大师的高雄佛光山，其宗旨就是“以教育培养人才，以文化弘扬佛法，以慈善福利社会，以共修净化人心”；了中长老于新竹创办玄奘大学；中坜圆光寺继续走教育之路，创办圆光佛学院，培养出大批高素质的佛教俊才；真华长老执掌新竹福严佛学院院务，倾心奉献；广元长老以书法弘扬佛法；净良长老专于佛教会务；宽裕长老专于寺务；而台北法鼓山创办社会大学、僧伽大学、中华佛学研究所，以教育与文化立寺兴寺；花莲慈济功德会则专注于慈善，号称会员300万，把慈善做到了世界；净心长老于高雄光德寺办有净觉僧伽大学、育幼院、养老院。这里，只是举几个典型的例子而已。